برهم خوردن تعادل باکتریایی در محوطه تناسلی زنان در بروز بیماری‌ها و اختلالات دستگاه ادراری تناسلی آن‌ها نقش دارد که پروبیوتیک‌ها با تقویت میکروفلور طبیعی محوطه تناسلی و تقویت سیستم ایمنی مانع بروز این مشکلات می‌شوند.
لاکتوباسیلوس‌ها با تولید هیدروژن پراکسید، کاهش جمعیت باکتری‌های مضر و تنظیم اسیدیته واژن مانع ایجاد عفونت دستگاه ادراری تناسلی زنان می‌شوند. طبق مطالعات علمی، لاکتوباسیلوس‌ها بعد از ورود و تکثیر در دستگاه گوارش، توانایی مهاجرت از طریق میاندوراه یا پرینه به محوطه واژینال را دارند تا پس از رسیدن به دستگاه تناسلی در محوطه تناسلی کلونیزه ‌شوند.